“生殖细胞变异”,癌症基因检测不得不防!
编者按:目前,为了降低成本,加快时间,大部分癌症基因检测仅分析癌症组织,并不分析生殖细胞DNA。这样做可能会导致误诊误断。本文将就此问题进行一系列的分析探讨。
据美国国家人类基因组研究所(NHGRI)和国家癌症研究所(NCI)的研究表明,仅通过分析癌症组织所得到的变异,其中就可能包含有生殖细胞变异,而这些变异会影响癌症治疗,建议实验室为此做好准备。
临床测序探索研究联合会(CSER)肿瘤工作组得到了NHGRI和NCI资助,其研究人员主要来自密歇根大学、哈佛大学、俄亥俄州立大学、宾夕法尼亚大学、德克萨斯儿童癌症中心和贝勒医学院,他们制定了一系列关于实验室进行癌症测序检测的指南,并将一些建议发表在《国家癌症研究所期刊》(JournaloftheNationalCancerInstitute)上。
据CSER工作组介绍,如果在实验过程中没有特地寻找生殖细胞变异,那么这些变异一旦被鉴定出来,就会对患者及其家属的管理产生影响,因此实验室应该注意这类变异。
本月初,纪念SloanKettering癌症中心的研究者报告称,通过使用包含341个基因的panel对肿瘤DNA的分析发现,16%的患者有致病性生殖细胞变异。另外,许多患者所检测出跟癌症风险相关的变异其实也是生殖细胞变异。这些生殖细胞变异也会影响患者的治疗和家属患癌风险的预测。
4月,约翰霍普金斯大学的研究者报告称,在没有与正常样本对照进行分析的时候,3%的患者所鉴定出的肿瘤变异实际是生殖细胞变异。
问题如何解决?
在CSER工作组的一篇文章中,研究人员表示:“不用直接分析生殖细胞DNA,仅从癌症组织测序结果中来识别和推断出生殖细胞变异,这一点能否实现是很重要的。”他们提供了这样的实例和实验室应该考虑的相应问题。
首先,癌症panel中通常包括一些比较公认的遗传性癌症突变基因,例如BRCA1、BRCA2和Lynch综合征的突变基因。
其次,一些变异模式也暗示着潜在的生殖细胞变异。例如,超突变肿瘤中DNA错配修复基因突变通常意味着生殖细胞变异,小儿成神经管细胞瘤中大型染色体重排也暗示着生殖细胞TP53基因变异。
另外,很多基因变异在生殖细胞和体细胞中都能观察到,这类基因通常为癌症易感性基因,包括MSH2、ALK、RB1、TP53和VHL。
生殖细胞变异,临床应格外注意
研究人员介绍,“鉴于变异分析和临床解读相结合的必要性,我们认为,医生和实验室应该共同解决生殖细胞变异的这一问题。”
工作组还建议,为癌症患者进行癌症panel、外显子或全基因组测序分析的实验室应该搭建生物信息学平台,用来鉴定生殖细胞变异。另外,实验室还应该制定适当的策略,用于证实潜在的生殖细胞变异。制定这套策略时应当考虑:如何从患者那里获得生殖细胞样本;实验室自己做检测还是与诊断机构合作。总之,实验室应该为鉴定生殖细胞变异制定一种标准化的方法。
此外,医生也有责任告诉患者,这种基因检测可能会发现遗传性突变,进而会对他们的治疗和家属患癌风险评估产生影响。医生也需要拟定一个方案,如何告诉患者生殖细胞变异的结果。
总而言之,由于基因检测可能会受到生殖细胞变异的影响,医生和实验室应该寻找有效的解决方案,以减少对患者的误诊。
用于某些抗生素难以控制的病毒性或霉菌性细胞内感染的辅助治疗(如带状疱疹、流行性乙型脑炎、白色念球菌感染、病毒性心肌炎等);亦可作为恶性肿瘤的辅助治疗;本品可用于湿疹、血小板块减少、多次感染综合症、慢性皮肤黏膜真菌病等免疫缺陷疾病。
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健客价: ¥104用于治疗寻常型银屑病进行期,冬季型症,属血热或兼血瘀证。症见皮肤红斑、鳞屑、清润肥厚、瘙痒、心烦、口渴或口干、便秘、溲黄等。
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健客价: ¥120主要用于脑部、周边等血液循环障碍。 1、急慢性脑机能不全及其后遗症:脑卒中、注意力不集中、记忆力衰退、痴呆。 2、耳部血流及神经障碍:耳鸣、眩晕、听力减退、耳迷路综合征。 3、眼部血流及神经障碍:糖尿病引起的视网膜病变及神经障碍、老年黄斑变性、视力模糊、慢性青光眼。 4、周围循环障碍:各种动脉闭塞症、间歇性跛行症、手脚麻痹冰冷、四肢酸痛。
健客价: ¥39用于治疗自然或术后绝经所致的围绝经期综合征。
健客价: ¥102主要治疗消化道肿瘤,对胃癌、结肠癌、直肠癌有一定疗效。也可用于治疗乳腺癌、支气管肺癌和肝癌等。还可用于膀胱癌、前列腺癌、肾癌等。
健客价: ¥45用于慢性胃炎、消化性胃及十二指肠溃疡、结肠炎以及消化不良。
健客价: ¥21用于治疗自然或术后绝经所致的围绝经期综合症。
健客价: ¥98用于某些抗生素难以控制的病毒性或霉菌性细胞内感染的辅助治疗(如带状疱疹、流行性乙型脑炎、白色念珠菌感染、病毒性心肌炎等);亦可作为恶性肿瘤的辅助治疗剂;本品可用于湿疹、血小板减少、多次感染综合征、慢性皮肤黏膜真菌病等免疫缺陷疾病。
健客价: ¥39临床可用于用于某些抗生物素难以控制的病毒性感染和或霉菌性细胞内感染。(如带状疱疹、流行性乙型脑炎、白色念珠菌感染、病毒性心肌炎等);对于恶性肿瘤可作为辅助治疗剂;免疫缺陷病(如湿疹,血小板减少,多次感染综合症急慢性皮肤粘膜真菌病有一定的疗效)。
健客价: ¥14活血化瘀,通脉止痛。用于瘀血闭阻所致的胸痹心痛,眩晕头痛,经期腹痛。
健客价: ¥15适用于恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤、淋巴细胞白血病、神母细胞瘤、卵巢癌、乳癌以及各种肉瘤及肺癌等。
健客价: ¥321、各型急性白血病,特别是急性淋巴细胞白血病、恶性淋巴瘤、非何杰金氏淋巴瘤和蕈样肉芽肿、多发性骨髓病; 2、头颈部癌、肺癌、各种软组织肉瘤、银屑病; 3、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、恶性葡萄胎、绒毛膜上皮癌、睾丸癌。
健客价: ¥52品适用于既往经表皮生长因子受体(EGFR)酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗时或治疗后出现疾病进展,并且经检测确认存在EGFR T790M突变阳性的局部晚期或转移性非小细胞性肺癌(NSCLC)成人患者的治疗。
健客价: ¥51000用于妊娠和哺乳期妇女、更年期妇女、老年人、儿童等的钙补充剂,并帮助防治骨质疏松症。
健客价: ¥48消肿散结、清热解毒,用于肺炎,阑尾炎。蜂窝组织炎,大剂量用于肿瘤。
健客价: ¥7主要用于:脑部、周边等血液循环障碍。 1.急慢性脑机能不全及其后遗症:中风,注意力不集中,记忆力衰退、痴呆。 2.耳部血流及神纤障碍:耳鸣、眩晕、听力减退、耳迷路综合征。 3.眼部血流及神经障碍等。 4.周围循环障碍:各种动脉闭塞症,间歇性跛行症、手脚麻痹冰冷、四肢酸痛。
健客价: ¥56用于某些抗生素难以控制的病毒性或霉菌性细胞内感染的辅助治疗(如带状疱疹、流行性乙型脑炎、白色念珠菌感染、病毒性心肌炎等);亦可作为恶性肿瘤的辅助治疗;本品可用于湿疹、血小板减少、多次感染综合症、慢性皮肤黏膜真菌病等免疫缺陷疾病。
健客价: ¥291.用于18岁以上的慢性乙型肝炎患者。因18岁以后胸腺开始萎缩,细胞免疫功能减退; 2.各种原发性或继发性T细胞缺陷病; 3.某些自身免疫性疾病(如类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等); 4.各种细胞免疫功能低下的疾病; 5.肿瘤的辅助治疗。
健客价: ¥35用于各种原因引起的白细胞减少症。亦可用于预防癌症放疗、化疗后白细胞减少。
健客价: ¥22多形性胶质母细胞瘤或间变性星形细胞瘤。
健客价: ¥2865