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“大数据”研究将癌症研究向前推进几十年

2017-03-20 来源:中国肿瘤时讯  标签: 掌上医生 喝茶减肥 一天瘦一斤 安全减肥 cps联盟 美容护肤
摘要:乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,是乳腺上皮细胞在多种致癌因子的作用下产生基因突变和/或表观遗传的转变而导致的细胞增殖失控。对其表观遗传机制的研究是目前研究的热门和难点之一。

  癌症的临床表型(肿瘤等级等)和细胞表型(形状等)与基因抒发之间的关系是癌症病理的基础,但是其中的机制并不是非常清晰。最近发表的一项研究利用影像大数据方法,树立了一张地图化的“形状/基因网络”,用来描写癌细胞形状与其基因表达之间的关系。

  乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,是乳腺上皮细胞在多种致癌因子的作用下产生基因突变和/或表观遗传的转变而导致的细胞增殖失控。对其表观遗传机制的研究是目前研究的热门和难点之一。

  近期,一项研究利用大数据剖析办法发现了一种细胞形状/基因网络。

  通过分析超过300,000个乳腺癌细胞的数百万个图像中的细胞形状以及超过28,000个不同基因的数据,研究人员发现可由肿瘤的物理压力引起的细胞形状变化转化为基因活性的变化。该研究揭示了一种新的疾病发展方向,将乳腺癌研究进展加速推进了“数十年”,将有可能为未来更优的治疗方法奠定基本。

  GenomeResearch上发表的这项研究表明,由CancerResearch(癌症研究)资助的科学家们创立了一张“地图”,它能够将乳腺癌细胞的形状与基因的开启和封闭接洽起来,并与真实的疾病成果相匹配。

  在这一首创性的方法中,他们应用从数百万的影像图片中得到的大批数据绘制出了一张地图化的网络,用于映射细胞形状与基因之间的关系。科学家们从映射关联中发现由肿瘤的物理压力导致的细胞形状变化被转化为基因活性的变化,并且这些变化与患者的临床结果相关。

  研究职员还肯定了网络内作为信息流动的枢纽来掌握许多其余基因程度的要害区域或“站点”。

  CancerResearch研究所内动态细胞系统团队的负责人ChrisBakal博士说:“我们的研究揭示了作用于癌细胞的气力与疾病进展之间的一种令人兴奋的联系。

  “利用‘大数据’方法,我们在几个月内就完成了原本可能需要几十年时间的复杂分析。我们已创建的关于细胞形状及其对基因活性影响的地图为新的癌症治疗方法提供了重要指标,也为现有的治疗方法供给了更有效的方法”。

  CancerResearchUK的首席科学家KarenVousden教学弥补说:“本研究中使用的见解和方法将可能让我们从外表就知道癌症的侵袭性和流传的可能性,从而辅助医生选择和制定最好的治疗计划。”

  这项研究强调了表型数据的重要性,它可以帮助我们更好地在分子、细胞和组织的水平上来懂得乳腺癌的发生情形。

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