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南京农大长江学者团队CEll子刊发表生物信息学分析冠状病毒重组与进化成果

2018-07-27 来源:中国病毒学论坛  标签: 掌上医生 喝茶减肥 一天瘦一斤 安全减肥 cps联盟 美容护肤
摘要:冠状病毒(CoV)感染主要引起呼吸系统(鸡传染性支气管炎病毒、犬冠状病毒)和消化系统疾病(猪传染性胃肠炎病毒、牛腹泻病毒、犬冠状病毒、猫冠状病毒等)。

 2016年3月21日,南京农业大学动物医学院以第一完成单位联合中国科学院微生物研究所,国家疾控中心等多家研究机构,在国际最顶级生物学期刊CELL杂志的子刊《TrendsinMicrobiology》(2014影响因子9.186)发表了题为“Epidemiology,GeneticRecombination,andPathogenesisofCoronaviruses”的论文。该文章第一作者和通讯作者为南京农业大学动物医学院长江学者周继勇团队的粟硕教授,共同通讯作者为中国科学院青年传染病专家毕玉海副研究员和中国科学院高福院士。

 
Figure1.GlobalDistributionofHumanCoronaviruses.(A)Green,blue,brown,andpurplerepresenttheglobaldistributionoftheNL63,HKU1,OC43,and229Ehumancoronaviruses,respectively.(B)RedandyellowrepresenttheglobaldistributionofMERS-CoVandSARS-CoV,respectively.
 
冠状病毒(CoV)感染主要引起呼吸系统(鸡传染性支气管炎病毒、犬冠状病毒)和消化系统疾病(猪传染性胃肠炎病毒、牛腹泻病毒、犬冠状病毒、猫冠状病毒等)。人的冠状病毒感染同样以呼吸系统疾病和消化道疾病为主要特征,但疾病发生程度有很大差异。到目前为止,主要感染人的冠状病毒有6种:229E、OC43、NL63、HKU1、非典型肺炎病毒SARS-CoV和中东呼吸热综合征病毒(MERS-CoV)。其中SRAS-CoV在2003年引起了8273人感染,其中775人死于该疾病。MERS-CoV是2014年又一次爆发,截止到2015年12月31日,该病毒引起1621人感染,584人死亡,成为对人威胁和危害性极大的疾病之一。
 
Figure2.Intra-andInter-SpeciesTransmissionofHumanCoronaviruses.
 
Figure3.PhylogeneticTreeofKnownAnimalandHumanCoronaviruses.
 
文章利用大数据序列分析手段,用最新的生物信息学分析方法从流行病学调查、发病机理、进化和重组情况等方面对不同的冠状病毒进行了比较分析。随后,用大数据网络监测和分析病毒序列并预测潜在威胁的动物源性重组冠状病毒,最后作者也提出未来待解决的冠状病毒频发重组可能感染人的防控问题,该文章对于目前冠状病毒流行病学的研究和防控具有重要的指导和参考意义。
 
Epidemiology,GeneticRecombination,andPathogenesisofCoronaviruses
 
Abstruct
 
Humancoronaviruses(HCoVs)werefirstdescribedinthe1960sforpatientswiththecommoncold.Sincethen,moreHCoVshavebeendiscovered,includingthosethatcausesevereacuterespiratorysyndrome(SARS)andMiddleEastrespiratorysyndrome(MERS),twopathogensthat,uponinfection,cancausefatalrespiratorydiseaseinhumans.ItwasrecentlydiscoveredthatdromedarycamelsinSaudiArabiaharborthreedifferentHCoVspecies,includingadominantMERSHCoVlineagethatwasresponsiblefortheoutbreaksintheMiddleEastandSouthKoreaduring2015.InthisreviewweaimtocompareandcontrastthedifferentHCoVswithregardtoepidemiologyandpathogenesis,inadditiontothevirusevolutionandrecombinationeventswhichhave,onoccasion,resultedinoutbreaksamongsthumans.
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