您的位置:健客网 > 肿瘤频道 > 医学前沿 > 技术突破!口袋大小就能全基因测序!

技术突破!口袋大小就能全基因测序!

2018-02-14 来源:转化医学网  标签: 掌上医生 喝茶减肥 一天瘦一斤 安全减肥 cps联盟 美容护肤
摘要:对同一个序列重复进行分析,结果会更好,但是在处理了大量的DNA之后,仍然有千分之一的序列存在错误。

 随着蛋白质孔、文库制备技术、测序速度和控制软件的改进,MinION纳米孔测序仪被用于为人类的全基因组测序。最近开发的MinION纳米孔测序仪只有口袋大小,最大读长却高达882kb。

 
最近,科学家使用只有口袋大小的MinION纳米孔测序仪对人类基因组进行了测序和组装。
 
这项研究于1月29日以“Nanoporesequencingandassemblyofahumangenomewithultra-longreads”为题发表在《NatureBiotechnology》上。
 
研究人员利用MinION纳米孔测序仪阅读了近千亿个碱基对,并分析了大量的DNA。该产品是为科学家专门设计的,但成本低至一千美元。其他DNA测序机的尺寸大约是一个标准的办公影印机的大小。
 
人类基因组被用作评估DNA测序仪器性能的标准,尽管测序技术有所改进,但以高精度和完整性组装人类基因组仍然具有挑战性。一般的DNA测序仪读长约为10kb,MinION使用纳米孔技术使读长高达882kb。
 
这项研究的作者、诺丁汉大学的MatthewLoose说:“有很多令人兴奋的事情。我们可以测序出更多的DNA片段,比以往任何时候都多得多。”Loose以及这项研究的其他作者都从Minion的母公司OxfordNanoporeTechnologies那里获得了一些资金。
 
纳米孔技术从穿过膜中的微孔的电压开始的。该设备通过电压驱动DNA,通过改变信号,将微小的变化转换成碱基对,然后转换成计算机可以分析的数据。
 
但是,与其他类型的测序仪相比,MinION检测的错误率是相当高的,大约高出几个百分点。对同一个序列重复进行分析,结果会更好,但是在处理了大量的DNA之后,仍然有千分之一的序列存在错误。MatthewLoose说,他们正在努力查找为什么存在这些错误——存在灵敏度问题,或者机器误读了分子本身的实际物理修正。
 
另外,做这个程序需要花费大量的时间,大约50,000个CPU时间。而且,一些分析软件根本无法使用纳米孔读数。
 
但是所花费的时间都是有回报的——该机器设法填补了12个人类基因组。目前,大约4%到8%的人类基因组仍有待测序。
 
很快,公司的另一台设备SmidgION应该能够直接在手机上进行测序。DNA测序仪技术将越来越便捷,如果你想知道香蕉在旅途中长出何种酵母,可是十分方便的。
 
看本篇文章的人在健客购买了以下产品 更多>
有健康问题?医生在线免费帮您解答!去提问>>
健客微信
健客药房