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MRSA感染又双叒叕暴发!NGS利器再显神通 | 临床微生物学杂志

2017-11-23 来源:转化医学网  标签: 掌上医生 喝茶减肥 一天瘦一斤 安全减肥 cps联盟 美容护肤
摘要:研究者提倡对暴露接触MRSA检测阳性患者的医务工作者要及时提倡医务工作者进行MRSA携带筛查,预防感染暴发。

   案例描述

 
  荷兰某医院肿瘤科入院5周的患者出现MRSA导致的菌血症。接触史追踪检测显示其中2例患者和1名医务工作者均出现耐夫西地酸MRSA感染。临床对医务工作者进行4个周期的MRSA有效去定植治疗,2位病患1位综合身体情况未做去定植治疗,另外1位自发失去MRSA定植能力。
 
  证据1
 
  耐夫西地酸的MRSA菌株在当地医院非常罕见,而早在入职筛查时,感染的医务工作者检出耐夫西地酸MSSA;
 
  证据2
 
  感染暴发之后医务工作者的丈夫检出也检出该罕见耐药MRSA菌株,但鼻拭子样本中分离MSSA。
 
  Tips
 
  也就是说,医务工作者早些时候筛查携带MSSA菌株,感染暴发期间检出MRSA菌株,而她的丈夫检出两种菌株共存,可能因为耐药菌株将耐药基因mecA转移至敏感菌株,最终该医务工作者携带了耐夫西地酸的MRSA菌株;鉴于夫西地酸耐药MRSA菌株在当地罕见,医务工作者与两位感染患者有接触史,医生推测其它两位感染患者的耐夫西地酸MRSA菌株可能源于该医务工作者携带的MRSA菌株。
 
  临床医生基于以上2点证据提出假说:最初携带耐夫西地酸MSSA菌株的医务工作者获得了水平转移的mecA耐药基因而成为MRSA菌株,进而传染至其它2位患者,导致肿瘤科感染暴发。
 
  检测结果
 
  01
 
  MLVA(多位点可变数目串联重复序列)分型鉴定所有菌株均为MT4053-MC0005;
 
  02
 
  基于NGS测序数据,多位点序列分型(MLST)进行序列分型,显示58株分离菌株均属于克隆群5,其中37株属于克隆群5中的ST5型;
 
  03
 
  全基因组MLST(wgMLST)和单核苷酸多态性(SNP)分析结果表明医务工作者分离菌株与感染患者、同事和家属分离菌株关系密切。
 
  Fig1.分离的MASA和MSSA菌株分子流行病学分析结果
 
  Fig2.基于NGS技术绘制分离的58株菌株最小生成树
 
  NGS技术验证感染暴发假说
 
  联合MLVA分型与基于NGS的wgMLST、SNP技术,本研究综合从分子流行病学方面证实了耐夫西地酸MSSA菌株获得了水平转移的耐药基因mecA导致肿瘤科感染暴发的假说,描述了医务工作者可以作为感染源导致感染大暴发。研究者提倡对暴露接触MRSA检测阳性患者的医务工作者要及时提倡医务工作者进行MRSA携带筛查,预防感染暴发。
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