随着芯片技术的不断发展,芯片技术的高通量特点使其成为大规模药物筛选以及实现肿瘤个体化治疗的重要武器。芯片技术的可重复性已经成为关注的热点,促使厂家不断地进行技术改进;对这一高通量实验方法的结果分析也已经成为一个日益重要的课题,而海量实验数据下的数据挖掘方法成为芯片研究的关键。
基因组学和蛋白组学始终是近年来基础研究的热点所在,在本次大会上有关这方面的内容包括了基因芯片、组织芯片、蛋白芯片的液质液相层析质谱(LC-MS)、表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)等多个方面的研究。研究的内容从肺癌的分子诊断、早期发现、特异性标志物的发现,扩展到了化疗疗效的判断、化疗耐药的机制以及对预后的影响。
Petersen等利用基因芯片分析了101例肺癌标本,根据基因表达谱的差异及其与预后之间的关系进行了聚类分析,结果显示,Ras、Myc、E2F信号通路下调的患者与Ras信号通路下调的患者相比,前者预后较差(2年生存率20% 对69%,P<0.05)。Lam等利用SELDI-TOF在51例化疗疗效为部分缓解(PR)或肿瘤进展(PD)患者中对化疗前后的血清进行了检测,发现这两组患者血清中8种蛋白的表达不同,可能与化疗的敏感性有关。
这些研究结果提示了基因组学和蛋白组学在肺癌研究中具有广阔前景,但对这一类方法的敏感性、特异性及可重复性仍有争议,而且对于海量试验结果的分析仍需深入探讨。
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