传统分类根据细胞类型将胸腺瘤分为上皮细胞型、淋巴细胞型、混合细胞型和梭形细胞型。
之后Levime和Rosai等根据肿瘤的侵袭性和肿瘤细胞的异型性将胸腺瘤分为良性胸腺瘤和恶性胸腺瘤,其中恶性胸腺瘤又分Ⅰ型、Ⅱ型。
近年来WHO将胸腺瘤分为A、B、C三型,其主要标准是:A型肿瘤上皮细胞呈梭形或椭圆形;B型肿瘤细胞呈树突状或上皮样;具有上述两者特征的称为AB型。其中根据逐渐增加的上皮细胞/淋巴细胞比例以及肿瘤上皮出现异型性的情况将B型又分为B1、B2和B3三个亚型。
另一大类非器官样的胸腺癌由于其形态大致与胸腺外的同类肿瘤相似,而称之为C型胸腺瘤。A、AB型为良性胸腺瘤,B型和C型为恶性胸腺瘤,其中C型为传统胸腺癌。
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