肝脏作为人体内最主要的解毒器官。对外来的或是体内的代谢所产生的有毒物质进行处理，使有毒物变成比较无毒的或溶解度较大的物质，随着胆汁或者尿液排出体外。
肝脏解毒主要有以下几种方式：
①化学方式：有还原、氧化、分解、结合和脱氨等作用，其中的结合方式是一个极为重要的方式。
当毒物和葡萄糖醛酸、硫酸、氨基酸等结合以后就会变成无害物质，从尿中排出体外。
体内氨基酸脱氨以及肠道内细菌分解含氮物质时所产生的氨是一种有毒的代谢产物，氨的解毒主要是在肝内合成尿素，随尿排出体外。当肝功能衰竭时血氨含量升高。
②分泌方式：一些重金属，比如汞，以及一些来自肠道的细菌可以经过胆汁分泌从而排出体外。
③蓄积方式：某些生物碱，如士的宁及吗啡可蓄积于肝脏，然后逐渐少量释放，以减少中毒程度。
④吞噬方式：肝静脉窦的内皮层含有大量的枯否细胞，具有很强的吞噬能力，可以吞噬血中的细菌、异物、染料及其他的颗粒物质。
据估计，门静脉血中的细菌大概有99％在经过肝静脉窦时就被吞噬了，因此，肝脏所起的这一滤过作用的重要性是非常明显的。许多激素一般在肝脏内经过类似上述的方法处理后就会失去活性，比如类固醇激素和抗利尿激素等。
但是某些肝病患者因雌激素灭活障碍而在体内蓄积起来，可能会引起性征的改变。
醛固酮和抗利尿激素的灭活障碍可引起钠和水分在体内潴留。肝脏的解毒功能经常会受年龄、昼夜节律、性别、饥饿、营养状态、妊娠、内分泌及遗传等因素的影响。
例如，新生婴儿是最容易发生氯霉素中毒的，原因之一是肝内生物转化酶系统的发育尚不是很完善；老年人对待氨基比林、保泰松等的转化能力比较差，所以用药后药效较强，不良反应也比较大。
氨基比林在男性体内半衰期约13.4小时，而女性只有10.3小时，这就说明了女性对氨基比林的转化能力强。
一些外源性的物质（如农药、毒物）或亲脂性药物可以使肝内的药酶合成明显增加，从而实现对其他药物的代谢能力逐渐增强，称为酶的诱导作用。
目前，已知至少200多种药物和化学物质具有酶诱导作用，如苯巴比妥、利福平、安体舒通等。药酶诱导作用有时可造成药物性肝损伤或化学致癌。
有些药物可以通过抑制药酶，从而使另一药物的代谢延迟下去，药物作用时间延长和加强，都被称为酶的抑制作用。
微粒体酶的专一性并不是很高，但是多种药物能够作为同一酶系的底物，从而出现了各种药物对药酶的竞争性的抑制，如保泰松可抑制甲磺丁脲的代谢，而增强其降血糖作用。
环境污染，以及各种毒素方面的刺激，尤其是肠源性内毒素所造成的损伤，经常会加重肝脏的负担，致使各种肝病的慢性化、重症化、纤维化以及癌变等。
所以，在治疗肝病的过程中，注重体内的除污工作对治疗是十分必要的。
慢性活动型肝炎、失代偿性肝硬化、肝癌等患者会因为机体的免疫功能低下，然后引发感染，使病情加重，甚至成为导致死亡的重要因素，其中一些来自胃肠道细菌的感染率占到了60％以上。
因此，必须要经常性地清除肠道内的一些有害细菌和毒素。肝病患者应该长期服用对清除胃肠内细菌、毒素污染的效果比较好的药物，不管对预防并发症、改善肝功能，以及提高生存、生活质量都是非常有利的。
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