流行性感冒的临床表现非常多，可累及到全身的各个重要器官和系统;流感症状包括有全身中毒症状、上、下呼吸道症状、消化道症状、中枢神经系统的症状等，全身中毒症状包括畏寒、高热、头疼、头晕、全身酸痛、乏力等，上呼吸道症状有咽痛、流涕、流泪、咳嗽等，下吸道症状有咳嗽、咳痰、咯血、呼吸困难、胸闷等;
有的患者还有食欲减退、腹痛、腹胀、恶心、呕吐和腹泻等消化道症状;中枢神经系统的表现可以有嗜睡、昏迷、惊厥及烦躁等精神症状，因为婴幼儿的中枢神经系统发育还不完善，感染流感病毒后容易发生中枢神经系统的症状。
流感的并发症很多，如肺炎、中耳炎、心肺功能的衰竭等。根据临床表现可分为单纯型、肺炎型、中毒型、胃肠型。婴儿流感的临床症状往往不典型，可因高热表现为惊厥，有的患儿表现为嗜睡、拒奶、呼吸暂停，有的患儿表现为喉气管支气管炎，有的可以伴有败血症。有基础疾病的老年人患流感后可能不出现急性中毒症状，而仅表现为神志淡漠、嗜睡、不思饮食等。
流感的临床表现缺乏特异性，所以在诊断流感时医生需要详细询问患者的流行病学病史，询问疾病的发生和发展过程，还需要与其他疾病(比如普通感冒、支原体肺炎、衣原体肺炎、嗜肺军团菌)等鉴别，当然诊断还是需要有病原学的检查，比如在患者呼吸道标本中检测到流感病毒特异的核蛋白、基质蛋白、血凝素蛋白，或从呼吸道标本中分离到流感病毒，或流感病毒抗体在2~3周有4倍以上的动态升高也可以协助诊断。
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