青年骨化纤维瘤最好的处理是手术切除，病变的进行性发展性质决定了病变需要早期手术干预，而不是像对许多骨纤维异常增生症病例那样对其观察一段时期，包括其他纤维骨性病变，手术处理取决于肿瘤的位置和范围。侵犯筛骨或上颌骨的肿瘤一般需联合耳鼻喉科医生予以手术切除，额骨病变通常与神经外科医生联合。通过额部经开颅切除，并且眶顶以劈开的肋骨片移植重建。侵犯蝶骨的比较广泛的病变或称为颅内中线并前颅窝骨化纤维瘤需要由若干专业人士组成的手术队处理。