一般认为椎管内结核瘤都是继发于身体其他部位的结核病变。主要原发灶为肺结核和结核性脑膜炎。大多认为肺结核经血液循环或结核性脑膜炎经脑脊液播散引起，少数可由结核性脊柱炎病灶扩散所致。国外有学者认为结核菌首先引起脊髓炎，然后病变会局限化形成结核肉芽肿。