磁朱丸为处方药，必须在医生指导下服用。磁朱丸含朱砂，不宜长期服用，并避免与含汞制剂同时服用，连续服用不宜超过两周；因特殊情况需长期服用，应检查血、尿中汞离子浓度和肝肾功能，超过规定限度者立即停用。服用磁朱丸时应避免与茶碱、心得安类药物以及含溴、碘如溴化物、巴氏合剂、三溴合剂、海带、海藻等物质同服。