口腔局部疾患是主要导致口臭的原因，但不容忽视的是，口臭也常是某些严重系统性疾病的口腔表现，有一些器质性疾患也会导致口臭症。病理性口臭分为口源性口臭和非口源性口臭。临床上常见的内科疾病如急慢性胃炎、消化性溃疡出现酸臭味；幽门梗阻、晚期胃癌常出现臭鸭蛋性口臭。口臭并不可怕，只要查明原因是可以治疗的。首先考虑口臭是口源性还是非口源性的,对于不能排除与口臭相关的因素，如呼吸系统疾病(鼻腔、 上颌窦、 咽部、 肺部的感染与坏死)、 消化系统疾病( 胃炎、 胃溃疡、 十二指肠溃疡、 胃肠代谢紊乱、 便秘等) 、 实质脏器损害(肝衰、 肾衰)及糖尿病性酮症、 尿毒症、 白血病、 维生素缺乏等，则应该先对这些疾病进行局部或全身的系统治疗。如有可能引起口臭的口腔疾病, 如未治疗的龋齿、 残根、 残冠、 不良修复体、 牙龈炎、 牙周炎及口腔粘膜病等，应该及时对龋齿进行内科治疗,拔除无用的残根残冠、 去除不良修复体、 去除不正确的解剖结构、 治疗口腔粘膜病,对于牙周病患者则先进行洁治和根面刮治等基础治疗,再进行系统的牙周治疗和菌斑控制。